千钧急忙带走柯南，向大叔道歉，暗道，“我要不把柯南放进去，你怎么破案啊？”毛利很快现窗户上的胶带，是用来消除割破玻璃声音的，窗外面雪地上也现了脚印。毛利侦探自得，“哈哈，我大致有眉目了。”柯南唔了一声，小五郎再给他一拳，“你唔什么啊！”柯南头上又起了个大包，小兰急忙抱住柯南低声安慰，又抱怨老爸。考虑到警察来不了，毛利无奈，只好让四位医学老师在尽量不破坏现场的情况下共同验尸，毕竟他们专业学医的还是比自己强一些，谁让自己晚上喝多了呢。
四人仔细检验尸体，飞田银二恼怒，“真过分，连大山老师最引以为傲的金表都沾满了血。”中原香织批评他都什么时候还说这些。很快就得出一致结论，死亡时间是在晚上9点半到1o点之间，那也正是大山看爱情电视剧的时间。死者身上伤痕累累，但致命伤是刺中肺部的那2刀引起的窒息而死，因为肺部被刀刺穿，就是想呼吸肺部也无法扩张才导致慢慢窒息死亡，死前大山将大概痛苦挣扎了一刻钟左右。
江角果步怒吼，“真可恶！到底是谁这么狠心？”小五郎冷笑，“大概是某个觊觎金钱的傻瓜干的吧！”毛利侦探开始推理，凶手由窗外潜入，从背后偷袭了大山教授，再把他绑起来，拿刀威逼他说出保险箱的密码。可是大山不肯，凶手破坏保险箱失败，盛怒之下刺了大山数刀，凶手可能觉得自己运气不好，只好放弃，最后跳窗逃走。柯南暗道真受不了叔叔了。
千钧觉得毛利侦探的推理看上去貌似合理，但还是有些问题，“拜托，大叔，凶手的运气真的不好吗？大山教授的金表他没道理没看到吧！当时凶手可是将大山的手绑在后面了！”柯南大叫，“这位死去的老伯才级幸运呢！”小五郎吃了一惊，“奇怪，劫财的凶手在没打开保险箱的情况下竟然没看到金表？这么说，难道凶手……”大家都很期待，小五郎大笑，“看来他是个糊涂的盗贼。”所有人都差点晕倒，柯南气乐了，“这个醉鬼……”
柯南只好提示，“可是，大家不觉得凶手很有胆识吗？”小五郎疑惑，柯南解释，“窗外的足迹是笔直朝着房间来的，那么就是说凶手凑巧看到大山先生一个人看电视入迷而起邪念。”小五郎还没反应过来，千钧经常偷窥跟踪立即明白了，“如果换成是我，一定担心被里面的人看到，我也不知道里面到底有几个人，所以一定会在窗外仔细窥视里面的详细情况再考虑是否潜入而不被现。”小五郎震惊，小雅和小兰都明白过来，“爸爸，该不会是……”“毛利叔叔，这个不是……”
小五郎醒悟过来，“嗯，我知道了。破坏保险箱，绑住大山教授都是为了装成劫财杀人的障眼法。因为凶手知道大山先生单独在房内看电视，而且非常入迷，不会看到窗外的情况。”小五郎转过身来，“换句话说，凶手就是你们4人中的一个。”几个人都生气了，“怎么能？”“不可能……”“当真……”小五郎开始仔细询问4个人的不在场证明，尤其是9点半到1o点的时间。
中原香织去了便利店买东西，出门是9点，回来是9:5o，随后跟大家在一起没有分开。香织拿出了大家买东西的单子，没买到的只有沙拉和冰淇淋。小五郎怀疑道，“如果开车快一点的话，早点赶回来……”香织大怒，“开什么玩笑！从别墅到便利商店来回至少要4o分钟。不信的话你可以开车试试！”小五郎急忙道歉，表示自己相信了。飞田银二去滑雪场滑雪，同样来回需要4o分钟，因为碰到大风雪提前回来，出和回来的时间与中原相差不多。他提出的证据是滑雪场的门票，上面有今天的日期以及具体时间，1997年2月3日，21:26.
毛利认为飞田的不在场证明非常完美，柯南询问，“那家滑雪场有没有小卖店？”飞田奇怪，回答确实有小卖店。千钧有些疑惑，小五郎这次先反应过来，“你们两个如果联手，一个去买零食和滑雪票，一个去杀人……”二人无不大怒，“别开玩笑了！”“拜托，乱猜也有个限度吧！”飞田提到那家小卖店根本没那么多东西卖，香织也提到滑雪场跟自己去的便利店是两个相反的方向，不可能一次去两个这么远的地方。
江角果步的不在场证明最为可靠，她跟小兰、小雅一起收拾桌子餐具，只有出去扔垃圾离开大家视线，那也不到5分钟，根本不可能犯案。金泽质康泡澡，一直从9点到1o点多，理由是浴缸现在还是温的。小五郎大怒，“胡说八道，浴缸自然可以随时加热！”日本的浴缸多配备加热器，所以大叔不接受这个辩解。金泽只好说，“香皂也有减少……”小五郎抓住他的衣领，大吼，“你敢耍我！快招，只有你没有不在场证明！”金泽拼命否认不是自己。
柯南觉得不对，千钧低声对柯南道，“江角果步的不在场证明最为充分，不可能是她。中原香织和飞田银二的话未必可信，最好的办法是明天亲自去便利店和滑雪场问问工作人员。”柯南点头，现在太晚了，可凶手到底是他们当中哪一个呢？柯南在现场继续查找，在沙上现一个染血的打火机，而沙上却没有血迹。千钧也疑惑，“应该是有人在血迹干了才放在这里，可是为什么呢？”柯南突然想起什么，匆匆跑向染血的桌布，千钧不明所以。柯南将打火机轻轻放在桌布洁白的方框上，“果然完全吻合，打火机原来是放在这里的。”柯南看着桌布呆，陷入沉思。千钧感觉一团迷雾一般，打火机放在桌布又转移到沙，太奇怪了。
柯南却想起大山将白天一直嚷嚷着有马的事情，而千钧、柯南、小雅、小兰的名字中都没有马。名字和马，果然是大山先生的遗言，柯南露出笑容，为何下跪，打火机为什么在沙上，凶手是谁的谜团都解开了，真相只有一个。随后柯南将打火机放回原处，打算将这件事告诉毛利侦探。小五郎正在询问证词，对柯南在身后捣乱大为恼火，“你给我安分点，小鬼！”柯南无奈，还是让他睡觉好了。
小五郎倒下来，千钧急忙上前将他扶到座位上，小兰询问父亲怎么了，千钧笑道，“好像醉了，大叔喝了很多酒嘛！”柯南跑到小五郎后面，用变声器话，“笨蛋，我才没醉呢，我都知道了。”小雅好奇，“毛利叔叔，你知道什么了？”“当然是凶手！我终于知道了那个将大山教授反绑，并将其杀之灭口的凶手是谁了。”众人都大吃一惊，“什么？”小雅追问，“好棒啊，凶手是谁？果然是他们当中的一个吗？”
“嗯，没错，从死亡时间来看，是从9:3o到1o:3o之间行凶的，而知道大山先生这段时间单独在房间看电视的只有你们4个。”小五郎开始依次解释，飞田银二夜间滑雪，门票上有确切时间，而且还宣称遇上大风雪回来。如果没去滑雪场的话，查一下就会露出马脚，所以证词比较可靠，不大可能是凶手。江角果步有明确的不在场证明，前后离开不到5分钟，绝不可能在这么短的时间用如此复杂的方法杀人，所以绝不会是凶手。
“这么一来，只有泡澡的金泽质康和买东西的中原香织没有确切的不在场证明。”中原香织恼怒辩解，再次强调自己买了东西回来，时间也非常急不可能有作案时间。“你的收据呢？在便利店买这么多东西，不可能没有收据！”香织恼怒，“我已经丢掉了。”千钧支持，“很多人买东西都随手把收据扔掉了。”小五郎冷笑，“那些零食一共多少钱？”香织一愣，低头思索。毛利哼了一声，“刚买的就忘了吗？不，我看你不是忘了，而是不知道。”千钧再次帮忙，“一下子买了那么多杂七杂八的东西，又过了2个多小时，谁还记得多少钱啊？”柯南腹诽，“你到底是那边的啊，不要看见人家漂亮就一个劲地帮忙。”小雅摇头，“你们男人比较大条，一般买东西的价钱，我们女人会记得比较清楚的。”
小五郎咳嗽一声，说出整个推理过程。中原小姐根本没有去便利店，而是在白天买火锅原料时就已经买好了种类很多的零食小菜，在行凶之前先问大家要买的东西，动车子离开只是装装样子而已，之后找了一个地方把车子停好，再从车子里把大家要买的零食挑出来,这么以来就有了不在场证明。然后再从容地潜入大山看电视的房间，将大山教授杀害。
大家都很震惊，香织恼怒，“我只是弄丢收据而已，你怎么可以这样说？”千钧也认可，“没有不在场证明的还有金泽先生，凶手为什么不能是他呢？”香织非常感激千钧一直帮忙，“对啊，你又没有证据，凭什么胡乱猜测！”小五郎哈哈大笑，“我看你是在装蒜吧，中原小姐！你应该也知道，房间里有足以证明你就是凶手的证据。”香织震惊，大家急忙询问，证据在哪里，小五郎回答，“在桌子上，血迹断的很不自然，你们不觉得上面本来有东西吗？”
小雅和小兰一眼就看出来了，是桌布的痕迹。随后二女按照小五郎的吩咐将桌布按照原来的血迹方向放在桌子上，“这就是手脚都被捆住的大山教授临死前留下的遗言。”大家都好奇观看，没看出什么啊。小五郎提示，“仔细看看上面的方格数，接着回想一下大山教授临死前的坐姿。这样你们就能注意到你们5人的名字都有共同点。”众人一起震惊，是将棋。“没错，大山教授之所以跪坐，把桌布布成9*9的格式，都是要让我们联想到将棋。而且巧的很，你们的名字刚好都有代表将棋棋子的字在里面。”
将棋，又称日本象棋，将棋的棋盘是一个由1o条横线及1o条竖线相交的方格阵，而棋子则置于方格之内，也就是9列9行的棋盘。靠近自己的3列是本阵，远离自己而靠近对手的3列是敌阵。将棋的棋子呈钟形，前端较尖。和中国象棋及国际象棋不同，将棋是以棋子前端的指的方向来区别所属。日本的将棋棋子包括王将（玉将）、金将、银将（成银）、飞将（龙王）、角行（龙马）、步兵（成步）、桂马（成桂）和香车（成香）等8种棋子组成。
大家立刻想到了，大山将代表王将，金泽质康代表金将，飞田银二代表飞将和银将，江角果步代表角行和步兵，中原香织代表香车。大家也想起大山教授总说有马就好了，原来是指的将棋中的桂马。小五郎见大家已经明白，“现在只差在棋盘上放上棋子。”然后吩咐小兰将沙上的染血打火机放在桌布上，那里只有一处吻合的地方。“如果完全吻合，自然就会看到凶手代表的棋子了。”
千钧也看出来了，“原来这个打火机代表的位置是……”小雅大叫，“是香车！”这个位置是棋局开始香车的位置，“换句话说，就是代表中原香织的名字暗号。”金泽询问，“毛利侦探，你为何在铺上桌布前就知道了？”毛利解释，只有那格血流得特别长，这表示打火机原来在桌角，这么一来事情就一目了然了。大家都明白了，原来如此。
中原香织在做最后的挣扎，“你有什么证据证明是大山老师留下的线索？搞不好是凶手故意陷害我呢！对了，也有可能桌布刚好掉下来，打火机也是恰巧放在那里的。”小五郎冷笑，“那你为什么要移动它，桌布是你掀掉的吧？”香织急忙否认，说自己什么也没碰，“一定是凶手和大山老师冲突时碰掉的。”千钧摇头，“不对，桌布和桌面接触的地方血迹的截断清晰可见，而沾血的打火机在沙上没有留下任何血迹，这表示确实有人在血迹干了之后移动过它。”
小五郎也接话，“更何况如果凶手想要陷害你，线索应该留的更加简单明了。而现在桌布掉了，打火机也飞到沙上。所以只能是凶手再度回到现场现线索后，情急之下采取的措施。”大家都惊讶万分，小雅回忆道，“第一个到达现场现尸体的人，中原小姐，就是你吧！”小五郎说出自己的完整推理。
原来，中原香织听说了毛利侦探的名声非常在意，为了确定大山是否已死，自告奋勇来房间查看情况，确定人死了之后就放声惨叫。在这之后她才现大山的坐姿和将棋的暗示，千钧他们听到惨叫声后急跑来，中原香织听到了脚步声，大大为焦虑不安，情急之下将桌布用力扯下来，上面沾血的打火机就掉到了旁边的沙上。对香织而言，不幸的是惨叫之后才现大山留下的遗言，早一点现的话就能处理干净。
“我说错了吗？中原香织小姐！”中原香织说不出话来，几个同事都惊讶看着她。小五郎说出怀疑她的地方，“你忘了买沙拉和冰淇淋，你说这两样东西都卖完了。但是在我们日本，沙拉是有可能卖完的，冰淇淋应该不会，更何况是这样的鬼天气。从这时我就怀疑你，如果不是卖完，而是没想到呢？如果当时你把所有的零食都买回来的话……”中原开口了，“够了，不要再说下去了！没错，是我杀了伟大的大山教授！”
江角果步非常奇怪，“香织，为什么？你们不是感情非常好吗？”“没错，我敬他如父，所以才更没有办法原谅他。”原来，大山将剽窃了中原香织用了6年心血完成的论文《大肠癌遗传基因之治疗研究》。中原香织的父亲在她小时候因大肠癌去世，她和母亲悲痛万分，她就决定完成医学上的创举，以阻止悲剧的进一步生。大山却堂而皇之地拿她的论文表出去，还厚颜无耻地说，“没用了，现在没人相信是你写的论文，而且以我知名教授的身份来表，人们才显得更为重视！这样你死去的爸爸会更高兴吧！哈哈……”
“我就是在那时定下了杀人计划，他竟然如此侮辱我的父亲，我就让他尝尝肺穿孔的痛苦。”中原香织抱臂而笑，“而他竟然能在痛苦的十几分钟里留下这样的线索，这是我始料未及的。而且，我也没想到你这位名侦探也凑巧来到了这里。”大家脸上都很难看，香织冷笑道，“名侦探，你有一个地方猜错了。冰淇淋和沙拉我都想到了，沙拉确实卖完了，冰淇淋我也买了。”
小兰问为什么没有拿出来，香织苦笑，“因为时间太长了，我开车的时候开了一会儿暖气，结果冰淇淋都在车里融化了。”中原香织露出凄美的笑容，“我真笨，竟然在那个男人点的冰淇淋上露出了马脚，真是太傻了！”这时，外面的风雪更大了，仿佛要泄世间的不平一样。千钧随后打电话将结果告知了目暮警官，目暮警官认为案件已经解决，就不亲自过去了。
天亮之后，佐藤警官和高木警官带队来到这里，取证完毕后，又给所有人做了笔录。毛利小五郎醒过来后，对这个结果非常自得，觉得自己又不知不觉破了一件大案。佐藤嘲笑毛利，在哪里过夜都会出人命，高木也深有同感，这已经不是第一次了。小雅却在抱怨，出来滑雪的好心情都被破坏殆尽了，千钧低声细语热情安慰她，小雅脸红，他又在打坏主意了。
毛利侦探事务所，柯南跟小五郎下起将棋。语言有时候也能用特殊的方式来表达，看似平凡之物，一旦换个角度就代表不同的意义。大叔占了上风，洋洋自得。柯南抓住了机会，“成功，终于完成了！”小五郎奇怪，“你不是还没将军吗？”柯南让大叔再往上点，从上面往下看，小五郎现将棋的拼图是笨蛋，毛利侦探大怒，柯南大笑奔逃……
尾声，中原香织因杀害大山将，被法庭判处5年徒刑。毛利小五郎破获雪山山庄将棋杀人事件，警视厅给以b级奖励，只不过瘟神、死神的称号开始正式流传出来。这起案子的起因是剽窃学生的论文，再一次引起学术界的关注，有关的知名人士呼吁大家不要让悲剧再次重演，应该坚决杜绝这种不道德得抄袭强占行为。