侍郎和斯琴美人遛出京城没几天，1629年10月中旬边关传来满清进犯遵化的廷报，原来清军在宁远聚集是假，绕道蒙古部落进攻西面长城是真，敌酋阿敏携攻破朝鲜之威，率3万清军攻破长城险隘喜峰口，再而围攻遵化城。闻听喜峰口被攻破，袁督师命赵率教统领5千马步兵增援遵化城，当赵总兵快到遵化城郊时清军已攻占遵化城，数万清军登时围住了援军。面对强悍的清军马队，赵总兵即使想逃也没了机会，与其被鞑子追杀不如拼死一战，5千军士持械奋勇向前砍杀，清军凶悍的骑马冲杀而来，一阵箭雨和铳枪的对射后，清军从正面和两侧包抄过来，弯弯的马刀和长柄大刀呼啸而至，随着咔嚓声和战马嘶鸣声响起，明军被清军象切瓜砍菜一样斩杀，不消半个时辰5千明军精锐部队被全歼，赵总兵也以身殉国了。
看着遍地肢体不全的明军尸体，清军头目阿敏纵声大笑，心想在平原地带清军如入无人之境，明军就象摆设一般不堪一击，他只留下数千部众守卫遵化城，立马带领大部队向京城杀去。
此时的京城早已慌乱不堪，守城部队只有一万多人，兵部在崇祯皇帝的授意下召回山海总兵满桂进京勤王，任命满桂为京畿部队总兵官，同时调集陕甘晋豫明军进京增援。袁督师紧随赵率教出动5千关宁铁骑向遵化城杀来，赶到遵化时清军已南下京城，看到遍地明军尸体，袁督师率部众向清军后面追去。
数万清军就象一股铁流直泄而来，几个时辰就赶到京畿郊外，正好与满桂率领的1万多山海明军遭遇，清军乘势一阵猛攻就把满桂部队杀得七零八落，满桂带着几百残军退到京畿西关与清军对峙，城头明军和召募来的20多万民众用铳枪弓箭和石块袭击清兵，没有炮队的清兵只好后退数里待机进攻。此时袁督师率领的5千关宁铁骑进发到京城广渠门外设防，清军向前与关宁铁骑对峙不前。
此时大明皇帝崇祯正端坐在城头，他怀抱祖传宝剑，太监、侍卫和兵部尚书等官员围在四周，他不能忍受清军围城的耻辱，大明立国二百年来从没遇到的危难降临到自己的身上，他立志要带领民众保卫国都。看到袁督师率领的精锐骑兵啸聚城下，崇祯传令袁部向清军展开攻击。
袁崇焕和祖大寿跪在城下呼唤：“吾皇万岁！臣等奔袭十多天鞍马劳顿，恐无战力与敌厮杀，恳请陛下开恩打开城门，待补充战力后再做筹划，以其两败俱伤不如守城一搏。”
崇祯大怒：“边将不得入城，你等是如何守卫边关的，5年平辽却召来清军侵袭京城，你们这是纵敌行为。”
袁崇焕和祖大寿等听后脸色大变，他们再次跪下扣拜，请求皇上了解他们的苦衷和现在的处境，希望马上能打开城门给予生路。
犹豫了片刻，崇祯想到还有军事行动需要安排，他只同意袁崇焕和祖大寿俩人进城议事，但不得打开城门，只能从城墙入城。几个太监找来两个大竹框，用粗麻绳吊到城下，待袁崇焕和祖大寿脱去铠甲和佩剑后才用力把他们吊上城头。刚从竹筐出来，俩人面向皇上跪下：“吾皇万岁万万岁！罪臣勤王来晚了。”
看着清军攻势已弱，崇祯的心稍有安定，他呼唤爱卿请起，说有重要军情到皇宫商议。城头只留下兵部尚书孙承宗等人坐镇指挥，然后带领贴身太监、侍卫和袁督师等人向皇宫走去。
崇祯在宫内平台坐定以后，他祥细的询问了此次清军入关的情况和勤王部队状况，责问袁督师为何不在半道上堵截清军。袁督师诚慌诚恐的陈述军力主要守备在宁锦和山海关一带，长城各口兵力不足守将懈怠，攻喜峰口时守将正在办理娶妾筵席，以至关破遵化城失守。派去遵化的赵率教等5千步军在城郊被鞑子斩杀怠尽，自己所率关宁铁骑骑行十多日未曾堵截到清军主力，现已人困马乏不俱战力，恳请皇上放军士入城休息几日再战。
皇上邹紧了眉头，他把遵化失守的怨气全都怪到袁崇焕的身上，加上清军兵临城下，恐怕边将再赚下城门纵敌入城，那京城和皇位就保不住了。他强硬的命令袁部只能在城外驻守，待陕甘晋豫十多万勤王部队进京时合兵一处再围歼清军，部队在城外自筹给养。袁督师看没有商量余地，只好低头走出皇宫。
袁督师前脚才迈出宫门，满桂就吊着受伤的胳膊气呼呼的来到宫外求见。原来满桂第二次带5千军士再次和清军死缠烂打时又被围歼，当他带着残部向广渠门靠拢时被袁军射杀，满桂左臂也受了箭伤。身为一品武官京畿总兵，皇上立马就召见了他。满桂跪过崇祯后就把受伤的经过叙说了一遍，并呈上那支刻有袁军印记的箭支。崇祯本来就心有疑虑对袁崇焕极为不满，在铁证面前他毫不犹豫的大叫：“袁贼卖国！传报立刻抓回袁贼，下到天牢待审。”
袁督师和祖大寿忧心忡忡的走到城头，一伙锦衣卫栏住了去路，二话不说就掏出金牌扭送着袁崇焕去督查院审讯，并传圣喻要祖大寿总兵统领畿辽兵马，祖大寿战战惊惊受命缒下城头。广渠门外的关宁铁骑一听说袁督师被抓群情激奋：“放了袁督师，我们要进城！”
“城下的军士听着，袁崇焕卖国投敌罪证确实，皇上领你们立刻向清军冲杀，否责你们也按通敌论处。”城头上传来太监们尖细的恶言恶语声。
看到进城补给无望，袁督师又被辑拿，几个副将和游击就合谋退兵，祖大寿本来就吓得够呛，同僚一挑拨就同意退回辽东，几千精锐骑兵绕城一周就要向北逃离，城墙上的军民在锦衣卫的挑拨下纷纷撂下砖石，数十个骑兵被砸到马下，气愤不过的军校们用弩箭和铳枪还击，一瞬间能和清军对抗的铁骑消散得无影无踪。
没有关宁铁骑威胁的清军又兵临京城，阿敏只留下数千骑兵监控京城，余部数万人马在京畿城郊大肆劫掠如入无人之境。数不尽的别墅庄园被洗劫一空，几十万民众被绑为满清奴隶，昔日繁华似锦的京畿要地变成一片废墟，赤地千里十室九空，哀鸿遍野哭声震天，一派末日景象。
崇祯心慌意乱，群臣手足无措无言相对，只有孙承宗镇定自若，他上谏劝皇上放了袁崇焕，与他兵权回援京城，崇祯心意已绝断然不肯：“袁贼反叛有据，若出如放虎归山，待督查院查实后定杀不赦，卿若再言与他同罪。”
在督查院受审的袁崇焕日子实在不好过，监查御史列举了他的八大罪状：耗费库银1000万两毫无建树，擅杀一品武官毛文龙，坐观朝鲜不救，为敌酋吊孝实属通敌，放纵清军进犯京城，指使手下箭伤京畿总兵满桂，边将入城居心不良，用人不当侍郎潜逃。面对以上罪名袁崇焕无言以对，他被押入天牢待皇帝下旨再定生死。
听说祖大寿带关宁铁骑北逃宁远，还有北投满清意愿，袁崇焕大叫不好，如果祖大寿真的投了满清，自己百口莫辩必死无疑，这时孙承宗派人劝袁督师召回祖大寿，袁崇焕立即写下了令祖大寿带兵回防的字据，心想即能带出令文，关宁铁骑必回不至投敌。
此时祖大寿已带兵回到宁远，京城不断传来圣喻让他回防，几个部下劝他北投满清，说回京城就是送死，袁督师至今生死不明，关宁铁骑擅离职守必是死罪。祖大寿犹豫几日后断然带兵北去，出行几个时辰遇到皇太极派出迎接的特使代善亲王，代善传达了皇太极圣喻，如到新京即封为王爷，任清兵部尚书之职从一品官衔。迎接之礼完毕代善回新京复命，突然宁远游击将军吴三桂骑快马赶到：“舅舅，京城传来袁督师急令，要您带兵即刻回防宁远，否则袁督师命将不保。”
展开袁督师蘸血指写的令文，祖大寿仿佛看到袁督师在狱中受罪的场景，回想往日袁崇焕对自己和部下不错，现在咋能为保命图富贵而害了督师的性命呢？祖总兵一声喝令，3万军马从敌我结合部向宁远退去，代善再次带领满清达官贵人和印信金银等物前来时已空无一人，代善只好叹口气回了新京。
祖大寿的回防确是暂时救了袁督师一命，但清军在京畿和北直录地区依旧是横冲直撞，过了七个月才满载金银财物和被俘精壮男女退回辽北地区。陕甘晋豫等地勤王的明军到了京畿要地时无人统一指挥管理，军饷和粮草无人筹措，这伙武夫们只好靠枪掠为生，然后三三俩俩退回本省防地，有不少溃兵乘势占山为王当了贼寇，陕甘等地的民乱越来越发不可收拾了。
袁崇焕在狱中苦度余生，他自知得罪人太多已无力回天，战局的稳定更是加快了他死期的到来，那些太监们大都得过毛文龙等人的好处，皇上耳里听的尽是关于袁崇焕的恶言，袁督师终被皇上判处极刑，在秋后的京城午们外问斩，几万名京城军民赶来观看袁督师的死状，刽子手们绑定了袁崇焕，他们起先猛的拍打袁崇焕的胸部，再割下他的左乳撂上天，再割下他的右乳撂下地。。。整整要割3600刀，观看的民众和官吏纷纷掏银子买袁崇焕的肉片，每片肉5两纹银，袁崇焕的气息越来越弱，他想起他的儿时在家乡结网打鱼，他想起青年时乡试和会试，他想起壮年时辽东抗清，他想起和孙承宗老师促膝谈心，他想起崇祯皇帝赐他的上方宝剑，他想起和刘志军品茶打麻将，现在的刘志军境况如何呢？最后袁督师默然的闭上了眼睑。